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HE染色法，即是蘇木精-伊紅染色法。石蠟切片技術里常用的染色法之一。蘇木精染液為堿性，主要使細胞核內的染色質與胞質內的核糖體著紫藍色；伊紅為酸性染料，主要使細胞質和細胞外基質中的成分著紅色。HE染色法是組織學、胚胎學、病理學教學與科研中基本、使用廣泛的技術方法。
易于被堿性或酸性染料著色的性質稱為嗜堿性( basophilia )和嗜酸性( acidophilia )；而對堿性染料和酸性染料親和力都比較弱的現象稱為中性（neutrophilia)。組織內的蛋白質構成蛋白質的氨基酸的種類很多，它們有不同的等電點。在普通染色法中，染色液的酸堿度為pH6左右，細胞內的酸性物質如細胞核的染色質、腺細胞和神經細胞內的粗面內質網及透明軟骨基質等均被堿性染料染色，這些物質稱為嗜堿性。而細胞質中的其它蛋白質如紅細胞中的血紅蛋白、嗜酸粒細胞的顆粒及膠原纖維和肌纖維等被酸性染料染色，這些物質稱為嗜酸型。如果改變染色液的酸堿度，pH值升高時，則原來被酸性染料染色的物質可變為嗜堿性；pH值降低時，原來被堿性染料染色的物質則可變為嗜酸性。所以說染色液的pH值可以影響染色的反應。
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